时光科研是1999版本上线的霍瓦尼亚区域周常挑战玩法，玩家需要先完成六人组系列主线任务，且将六人组声望提升至“披萨派对”等级，之后前往霍瓦尼亚找到卡娅即可交互开启。每周解锁时光科研需要消耗2个搜索脉冲，这一道具与衰退室、深层科研共用资源池，每周系统固定刷新5个，因此玩家需要合理规划每周的脉冲分配。
时光科研的核心机制为连续闯关模式，玩家解锁后需要一次性完成3个预设任务，中途无法更换战甲、武器与配装，一旦任务失败或主动退出，再次进入时需要从第一个任务重新开始。三个任务的过程中会有专属NPC提供协助，第一个任务由维利米尔支援，第二个任务更换为米尼娃，第三个任务两名NPC会同时登场辅助作战，一定程度上降低了单人挑战的压力。
玩法内的敌人以炽蛇军与科腐者为主，普通难度下敌人等级区间为350至375级，精英难度则提升至475至500级，且每周卡娅都会刷新任务组合与风险词条，没有固定的通关模板，需要玩家根据当周词条调整配装思路。研究点数是时光科研奖励结算的核心依据，点数计算小队成员之间互不共享，仅以自身开启的难度参数计算最终收益。
基础状态下通关全部三个任务可以获得3点研究点数，每启用一项个人难度参数，每个任务都会额外增加1点，全部8项参数拉满后可以额外获得24点，叠加基础点数普通难度最高可达27点。解锁精英难度后通关会额外增加10点，精英难度拉满参数的情况下最高可以获得37点，且玩家只需在普通难度下达到25研究点数并通关一次，就能永久解锁精英科研权限，后续每周无需再重复挑战普通模式。
