游戏里的蘑菇种类是非常多样的，除了只有在火山地牢才能采集到的熔岩菇之外，所有的蘑菇类型都能通过选择蘑菇山洞，在两天一生成的山洞里采集到。除此之外玩家还能在矿井浅层区域直接遇到红蘑菇，采集后能增加七点采集经验，红蘑菇是不具备食用特质的，如果不慎吃掉是会减少一定的能量。在夏秋两季的秘密森林，以及秋季的森林农场里也会生成红蘑菇。如果用蘑菇树桩培育蘑菇，放在枫树旁是能很大增加红蘑菇的产量。
蘑菇树作为秋季出现的树，能用斧子砍伐掉落红蘑菇或者紫蘑菇，树液采集器放在蘑菇树上则是会产出红色、紫色以及普通蘑菇。红蘑菇作为礼物送出是没有任何村民喜欢，对于走收集包献祭路线的玩家来说，红蘑菇是工艺室里献祭的物品之一。紫蘑菇在矿金81层以上才会遇到，骷髅洞穴则是在每层都有概率出现，紫蘑菇可以作为下矿很好的恢复物品，普通品质的紫蘑菇就能增加56的血量和125的能量，将其送给法师是能得到最爱的态度，能很好的增加与法师的友谊值。同样紫蘑菇也是能作为收集包献祭物品，在布告栏和工艺室里都有着紫蘑菇的需求。鸡油菌的获取方式是相对较少的，在秋季的秘密森林有概率会生成这类蘑菇，将其作为礼物是能得到哈维、莉亚以及流浪汉莱纳斯的喜欢。
羊肚菌也是能在秘密森林或者森林农场中采集到的，在春季就有一定概率生成，将蘑菇树桩放置在橡树旁，则是能产出羊肚菌。与德米特里厄斯的好感达到三心时，玩家就能收到炒蘑菇的食谱，制作所需的原料就有着一个羊肚菌，食用后能为角色提供持续七分钟的攻击增益，能让玩家下矿击杀怪物有着更好的强度。当角色的战斗等级到达二级的时候，就能学会生命药水的制作配方，它的制作需要以上四种蘑菇各一个，其效果能直接增加百分比的血量，而获取这些蘑菇最简单的方法就是选择蘑菇山洞，对于经常下矿与怪物战斗的玩家，蘑菇山洞是非常不错的选择。普通蘑菇的获取方式也是比较多的，它是秋季野外采集物之一，通过秋季种子是有概率长出普通蘑菇。春秋两季玩家能在秘密森林中采集到，夏秋两季在森林农场则是能找到它。
将普通蘑菇放到种子生产器里，能最多产出三个秋季种子，以这种方式获得秋季野外种子是要比直接制作简单不少。普通蘑菇在烹饪里是炒蘑菇、椰汁汤和蔬菜什锦盖饭必备的原料，其中椰汁汤是游戏内少有的增加体力上限的菜肴。游戏内的所有蘑菇都是可以通过烘干机来做成蘑菇干，不过能得到的收益是相对较少的，在玩家选择蘑菇山洞后会附赠一个烘干机，对生命药剂没有太大需求的玩家，则是可以将任意五个蘑菇放入烘干机，一天后就能得到蘑菇干。
