文明6核弹投放后占领城市的核心流程是等待或清理核辐射、部署近战单位进场、完成占领操作、稳定城市秩序并做好防御反扑准备，按此步骤执行即可高效拿下目标城市。核弹会直接将目标城市的城防与生命值清零，摧毁区域内建筑与设施，同时留下持续掉血的辐射污染，此时远程单位、空军均无法完成占领，必须依靠陆军近战单位执行最终占领动作。投放核弹前需将己方部队撤至爆炸范围外，避免被波及歼灭，同时在城市外围安全距离部署好坦克、机械化步兵、现代装甲等主力近战单位，搭配医疗兵与侦察兵组成占领编队，确保辐射消退后能第一时间推进。
核爆后目标城市地块会呈现红色辐射状态，单位进入会持续损失生命值，普通核弹辐射持续约10回合，氢弹辐射持续约20回合，可通过地块信息面板查看剩余污染时长。等待辐射自然消散是最稳妥的方式，也可派遣工人或军事工程师主动清理辐射，多个工程师协同能大幅提升清理效率，优先清理城市中心及周边关键地块，为部队进场扫清障碍。辐射完全清除后，立即指挥待命的近战单位向城市移动，途中用侦察兵排查敌方残余部队，避免占领单位遭伏击，医疗兵跟随编队随时回复单位血量，保障部队完整战力抵达城市。
近战单位进入无辐射的城市中心格时，会自动触发占领选项，可选择吞并城市、解放城市或摧毁非首都城市，吞并后城市会进入军事管制与叛乱期，产出大幅降低且忠诚度下滑。占领后需立即在城市及周边部署防空单位，如战斗机、防空导弹车、导弹巡洋舰等，防范敌方发动核报复或空袭夺回城市，同时派遣工程师修复被摧毁的城区与建筑。优先重建粮仓、水厂等基础设施，快速恢复城市人口与基础产能，通过驻军、派遣总督、建立贸易路线、建造纪念碑等方式提升城市忠诚度，避免因忠诚度过低导致城市叛乱独立。
核弹占领战术会触发严重的战争狂惩罚，引发全球文明外交谴责，甚至触发核危机紧急状况，招致多国联合宣战，需提前强化整体国防布局。占领多座城市后，要合理分配兵力防守，防止防线过长被敌方逐个击破，同时利用占领城市的资源加速军工生产，补充兵力与核武储备，巩固征服成果。若目标文明未被完全消灭，和谈时可通过谈判迫使对方割让已占领城市，彻底确立领土主权，减少后续外交与军事隐患，确保核武打击后的占领成果长期稳定。
