乱斗西游2的副本系统分为常规剧情副本、精英副本、实时组队副本和特殊活动副本四大类。常规剧情副本是推进主线故事的核心玩法，每章包含6个关卡，通关后可解锁扫荡功能并获取装备强化材料。精英副本难度较高，但首次通关会掉落英雄灵魂和稀有装备碎片，每日扫荡次数有限制。实时组队副本需要2-3名玩家协作完成，包含叱咤倾锋·心魔劫等动态关卡，胜利后可获得金色法宝升级材料。特殊活动副本如鹊桥仙、幻世风华等具有时效性，通常结合节日主题设计，通关后能兑换限定时装或稀有道具。
剧情副本的关卡设计具有递进式难度曲线，后期关卡需针对性搭配阵容。第20章之后的部分关卡要求英雄血量不低于40%或防御塔无损，建议优先培养地藏菩萨、弥勒佛等坦克类英雄。精英副本的Boss机制更复杂，例如21-6关的荡魔天尊会召唤枪兵并触发90%减伤状态，需利用火德星君元神的控制效果配合高爆发输出。实时副本中的熔铁神将机制要求玩家争夺地图中央召唤区，携带肉盾英雄可享受15%额外减伤效果。
资源分配方面，建议优先消耗体力扫荡已通关的精英副本，稳定获取英雄升星材料。组队副本奖励次数每日重置，可搭配帮派成员提高通关效率。活动副本的道具兑换需规划优先级，例如凌云壁应优先用于购买天运宝匣而非低级装备。经文系统对副本通关有显著影响，罗睺、罗汉、无量等防御类经文能有效提升生存能力，而法华、妙觉等攻击类经文适合输出型阵容。
鹊桥仙副本需组队使用异性英雄，通过诗词答题环节后迎战唐僧Boss，最终奖励与答题正确率挂钩。幻世风华副本则采用随机季节试炼机制，通关后概率掉落北海龙王时装。多人副本如碑谷存在隐藏Boss设定，每周仅能挑战三次，胜利后可获得橙色圣器碎片。需注意部分副本设有战力门槛，例如实时副本要求基础战力超过20000。
