逃离塔科夫的健康系统较为特殊，区别于其他游戏的生命值设定，其生命值由头、胸、胃、双臂、双腿七个独立部位的血量共同构成，基础值为440点。头部与胸腔属于致命部位，受到伤害导致血量归零会触发死亡，仅由失血引发的血量归零不会立刻致死，但该部位会进入损毁状态，此时任何额外伤害都会直接造成死亡，且损毁的头胸部位无法通过工具修复。
胃部损毁不会直接致命，但会让水分与能量的消耗速度提升至基础值的五倍，同时持续产生咳嗽暴露位置，额外受到的伤害会以1.05倍系数分摊至全身。双臂与双腿属于肢体部位，骨折状态会分别影响交互速度与移动，右臂骨折会使物品使用、搜索容器速度降低50%，换弹与瞄准时间增加67%，左臂骨折对搜索速度的削弱达到67%，换弹速度降低50%，腿部骨折则会限制奔跑与跳跃动作，移动速度大幅下降。
肢体部位血量归零进入损毁状态后，后续受到的伤害会以0.49倍的系数分摊至全身所有部位，损毁的肢体可以通过外科手术包恢复至1点生命值，且多次手术会逐步降低该部位的最大血量上限。除了部位伤害，健康系统还包含多重持续状态效果，流血分为轻微与重度两个等级，轻微流血每6秒损失少量生命值，重度流血每4秒造成大量生命值流失，未及时止血会持续消耗直至角色死亡，且流血状态会同时加快水分与能量的消耗速度。
