让一个独立城市或敌方城市投降，核心在于通过压倒性的军事优势或综合国力影响，迫使其统治者接受和平条款并归附于你。实现武力征服是迫使城市投降最直接的手段。你需要对目标城市发动战争并取得绝对优势，具体操作上，必须使用近战单位对城市发动最后一击才能完成占领。在进攻前，应先用远程单位或攻城器械如投石车，持续消耗城市的城防值，城防值取决于城市人口和防御建筑。当城市生命值被削减至零时，由相邻的近战单位执行占领，此时会出现选择占领或夷平的选项。选择占领后，该城市便归于你的文明，但初期会面临忠诚度压力和外交谴责。
促使敌方主动投降，则依赖于你在战争中对敌方整体造成的巨大压力。游戏设有明确的投降判定机制：两国交战必须满十个回合以上，否则对方不会考虑投降。目标文明必须至少拥有两座或以上的城市，仅剩最后一座城市时它绝不会投降。目标文明的整体宜居度需要为负数，这意味着你需要通过劫掠其奢侈品资源等方式降低其民众满意度。也是最关键的一点，你与对方的军事实力差距越大，对方投降的速度就越快。当这些条件同时满足时，敌方领袖便有可能在外交界面提出和谈并割让城市。
除了正面军事压迫，通过非武力手段施加影响也能为劝降创造条件，这主要围绕忠诚度系统展开。一座城市如果忠诚度降至零，便会脱离原文明成为自由城市。你可以通过文化输出、宗教传播（让该城市半数以上人口信仰你的宗教）或在邻近格部署大量你的公民（文化炸弹效应）等手段，持续施加忠诚度压力。对于已叛变的自由城市，你可以选择再次通过武力占领，也可以通过高忠诚度压力使其自然归顺于你。一些文明如阿基坦的埃莉诺，其特殊能力可以直接通过文化影响力夺取敌方城市，这提供了另一种无战征服的路径。
新获得的城市会处于被占领状态，忠诚度极低且可能发生叛乱。你需要立即采取稳定措施，例如派遣总督前往该城、修建驻军单位、启用增加忠诚度的政策卡，或通过贸易路线、娱乐设施提升其宜居度。如果城市位置战略价值低或你难以维持其忠诚度，也可以考虑在外交中将其交易给其他文明，或直接夷平以杜绝后患。
